Проблемы при работе с кириллицей в PHP-скриптах функций strtoupper() и strtolower() возникают, когда неправильно определена текущая локаль (locale). Для правильного её определения следует воспользоваться функцией setlocale() в самом начале вашего PHP-сценария:

<?php

setlocale(LC_ALL, 'ru_RU.CP1251');

echo strtoupper('Работает!');

?>