В поле запускаемой команды пишите для запуска:
PHP Скриптов:
/usr/bin/wget -q -O /dev/null -nd http://www.domain.name/script.php
CGI Скриптов:
/home/username/public_html/cgi-bin/script.cgi
* где username — Ваше имя пользователя в системе